Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc8P09025 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms