Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Col4a2P08122 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms