Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms