Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01809 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01809 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01809 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01809 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01809 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms