Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01808 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01808 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01808 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01808 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01808 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms