Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01665 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01665 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01665 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01665 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01665 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01665 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01665 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01665 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01665 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01665 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms