Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01657 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01657 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01657 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01657 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01657 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01657 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01657 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01657 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01657 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01657 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01657 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms