Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01656 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01656 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01656 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01656 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01656 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms