Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01654 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01654 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01654 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01654 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01654 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01654 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms