Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01652 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01652 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01652 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01652 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01652 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01652 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01652 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01652 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01652 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01652 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms