Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01629 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01629 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01629 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01629 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01629 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms