Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifnb1P01575 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms