Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MscO88940 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MscO88940 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MscO88940 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MscO88940 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MscO88940 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MscO88940 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms