Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnkO88874 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CcnkO88874 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcnkO88874 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcnkO88874 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CcnkO88874 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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