Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hcn2O88703 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms