Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RradO88667 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RradO88667 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RradO88667 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RradO88667 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RradO88667 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RradO88667 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RradO88667 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RradO88667 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RradO88667 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RradO88667 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RradO88667 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RradO88667 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RradO88667 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RradO88667 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RradO88667 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RradO88667 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RradO88667 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RradO88667 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms