Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrp6O88572 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrp6O88572 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms