Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dll3O88516 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dll3O88516 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Dll3O88516 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dll3O88516 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms