Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CntfrO88507 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CntfrO88507 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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CntfrO88507 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
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CntfrO88507 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CntfrO88507 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CntfrO88507 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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CntfrO88507 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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CntfrO88507 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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