Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capns1O88456 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms