Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AurkcO88445 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AurkcO88445 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms