Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms