Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnnal1O88327 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms