Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CaskO70589 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CaskO70589 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CaskO70589 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CaskO70589 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CaskO70589 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CaskO70589 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CaskO70589 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CaskO70589 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CaskO70589 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CaskO70589 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CaskO70589 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CaskO70589 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms