Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtssO70370 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CtssO70370 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CtssO70370 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtssO70370 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtssO70370 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtssO70370 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtssO70370 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms