Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf5O70191 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf5O70191 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms