Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51dO55230 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms