Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt5hO55201 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms