Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx4O55187 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx4O55187 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms