Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn20O55082 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms