Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole2O54956 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pole2O54956 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms