Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccr6O54689 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccr6O54689 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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