Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek2O35942 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Nek2O35942 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Nek2O35942 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Nek2O35942 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Nek2O35942 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Nek2O35942 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Nek2O35942 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek2O35942 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms