Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm2O35900 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm2O35900 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms