Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klf9O35739 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Klf9O35739 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Klf9O35739 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klf9O35739 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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