Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms