Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NudcO35685 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NudcO35685 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NudcO35685 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NudcO35685 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NudcO35685 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NudcO35685 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NudcO35685 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NudcO35685 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NudcO35685 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NudcO35685 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NudcO35685 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NudcO35685 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NudcO35685 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NudcO35685 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NudcO35685 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms