Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clk4O35493 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clk4O35493 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms