Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms