Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atf6bO35451 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms