Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcc1O35379 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms