Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f3O35261 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f3O35261 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f3O35261 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f3O35261 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms