Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms