Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx3O35160 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx3O35160 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms