Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarb2O35114 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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