Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnih2O35089 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cnih2O35089 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms