Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ArxO35085 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ArxO35085 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ArxO35085 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ArxO35085 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ArxO35085 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ArxO35085 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ArxO35085 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ArxO35085 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArxO35085 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArxO35085 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ArxO35085 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms