Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha8O09127 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha8O09127 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha8O09127 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms