Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gfra2O08842 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra2O08842 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms