Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Fpr-s1O08790 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Fpr-s1O08790 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Fpr-s1O08790 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Fpr-s1O08790 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fpr-s1O08790 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fpr-s1O08790 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fpr-s1O08790 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fpr-s1O08790 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Fpr-s1O08790 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Fpr-s1O08790 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Fpr-s1O08790 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fpr-s1O08790 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fpr-s1O08790 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fpr-s1O08790 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms